从旧花园巷一侧望去，两座对称的塔楼耸立于围墙之上，更深处则升起一座高大的肋拱穹顶。圣门形成一条严整的轴线：塔楼、拱门、塔楼、穹顶。尽管主教座堂的下半部被围墙遮住，路人首先注意到的正是这一秩序。在“捉鬼人”游览路线上， 伊万诺夫斯基修道院 成为伊万诺沃山岗的一处重要景点；徒步游览从外部走近修道院。
米哈伊尔·贝科夫斯基将主教座堂、回廊、大门、塔楼和各栋建筑统一于一个整体构图之中。然而在19世纪中叶，这里只有遭火焚毁后改作他用的建筑。1812年大火后，修道院被撤销，修女们被遣散，修复后的主教座堂则改为堂区教堂。此后数十年间，这里的“修道院”一词仅指向往昔。
为一座空寂修道院立下的遗嘱
1856年春，中校遗孀伊丽莎白·阿列克谢耶夫娜·马卡罗娃-祖巴切娃向都主教菲拉列特递交了一份请愿书。她提议自费在原址恢复一座实行共住制的女子修道院。请求写得十分详尽，几乎像一份事务规划：二十五名修女、二十五名见习修女，以及明确配置的神职人员和仆役。
方案从一开始便包括一所附设教堂的医院，以及供六名年迈修女居住的修室。马卡罗娃-祖巴切娃打算也住在那里，亲自照料病人。后来，规划中又加入一所学校，招收二十四名出身贫困神职人员家庭的孤女。学校计划教授教理、历史、地理、算术、俄语、教会歌唱和手工艺。修道院的复兴从一开始便与重建共同生活紧密相连。
取得许可、绘制图纸，以及安置旧楼中的住户都需要时间。伊丽莎白·阿列克谢耶夫娜的健康状况却日益恶化。1857年12月31日，她立下遗嘱：变卖不动产，将动产和收回的债款兑换成现金，并把所得资金用于伊万诺夫斯基修道院。她指定亲属玛丽亚·亚历山德罗芙娜·马祖里娜全权负责此事。
马卡罗娃-祖巴切娃于1858年3月31日去世。同年5月，遗嘱获准执行，马祖里娜正式取得遗嘱执行人的权利。随之而来的还有诸多责任：腾空被占用的房舍、购置不动产以替换修道院原有建筑、与宗教事务局通信、协调设计方案并负责施工。
1859年，修复案及其所附图纸获得宗务会议和沙皇的批准。新建筑群的设计者是米哈伊尔·贝科夫斯基。他此前已为莫斯科的修道院完成过许多项目，是历史主义建筑师中的一员，善于根据建筑用途选择相应的艺术语言。他为伊万诺沃山岗设计的方案，与当时占据主流的俄罗斯—拜占庭风格迥然不同。
工程首先要拆除旧建筑。1860年初，在贝科夫斯基的监督下，人们开始拆除破败的房屋和原有的主教座堂。历史学家伊万·斯涅吉廖夫曾数次来到工地。他在日记中记下了被拆卸的圣像壁、教堂和食堂下方的拱顶通道、16至17世纪的墓碑，以及七口钟。施工让那些通常隐藏在地板下和墙体深处的遗迹短暂重见天日。
马祖里娜竭力争取由菲拉列特亲自主持奠基仪式。由于都主教患病且事务繁忙，仪式推迟了一个月。1860年9月3日，他先在附近的圣弗拉基米尔教堂主持礼拜，随后宗教游行队伍来到已经清理完毕的场地。人们在此为主教座堂和医院教堂奠基。奠基时准备了一块八乘九俄寸的镀银铜板；铭文记载了教堂、各祭坛、捐资者以及即将恢复的修道院。
后来，瓦西里·鲁德涅夫神父根据马祖里娜的讲述，记录了她与菲拉列特在奠基仪式后的对话。玛丽亚·亚历山德罗芙娜问道，以自己孱弱的身体，能否完成已经开始的事业。留下来的回答很简短：“您会活着看到它建成。”在随后多年里，马祖里娜负责石匠、承包商以及与各部门的往来通信，这句话始终伴随着她。
石材、工期与未竟的装饰
文献让人重新感受到这项工程沉甸甸的实体分量。1861年2月15日，马祖里娜与市民阶层出身的诺斯科夫签订了石材加工合同。承包商承诺，每名工头手下至少配备三十名“粗石工”，按照建筑师规定的尺寸和要求凿制石材，并在6月10日前完成砌筑。然而他未能如期完工。马祖里娜将承包商告上法庭，并另聘新人。
1860至1861年间，工人拆除了原有的主教座堂，将新教堂的地下层砌筑至基座高度，并完成了医院楼、圣门和回廊的封顶。钟楼及与之成对的塔楼也建至最高一层。与此同时，原印刷所楼得到改建，院长住宅也拔地而起。在这片狭窄的场地上，多项工程同时推进，并由同一条轴线贯穿相连。
到1862年末，主教座堂的墙体已经封顶，墩柱之间的拱券也已合龙，各栋建筑内的石作和木作工程接近完成。次年施工季，人们在主教座堂上方砌筑了穹顶拱壳，并搭建了覆以铁皮的木质穹顶结构。塔楼顶部出现了以铁架支撑、由白石板拼成的尖顶；回廊则进入收尾和抹灰阶段。
贝科夫斯基通过空间的层层展开营造观感。从街上望去，围墙遮住了主教座堂的基部，穹顶却在远处便清晰可见。两座塔楼之间的大门通向庭院，拱廊从这里将视线引向主教座堂的正立面。步入内部，一座采用中心式布局的四柱教堂展现在眼前。研究者将其肋拱穹顶与佛罗伦萨的圣母百花大教堂相比，又将塔楼与乔托钟楼相提并论。贝科夫斯基并未照搬佛罗伦萨的建筑，而是将这些意象与东正教的空间布局和俄罗斯装饰体系融为一体。
1864年，穹顶覆上铁皮，主教座堂、塔楼和医院教堂所需的穹顶顶冠也已订制，抹灰及内部工程继续推进。1865年1月，马祖里娜向教区监督司祭报告，设计方案中的所有建筑均已建成。不过，贝科夫斯基的说明中仍有一项重要保留：最终装饰预计最早也要到1867年末才能完成。
墙体建成后，还要让修道院真正运转起来：完成房舍装饰、确保稳定收入、制定章程、选定院长并组建修女团体。菲拉列特一直参与这些事务，直至1867年去世。此后，马祖里娜又继续工作了十一年。人们很少能从穹顶的轮廓中读出她的名字，然而正是经她之手，遗赠的资金化作一份份合同、报告、买卖契据和竣工的楼宇。
没有女建堂人的启用典礼
玛丽亚·马祖里娜于1878年10月21日去世，距修道院启用只剩一年。她去世后，人们成立了修道院复兴委员会，由尼科洛-乌格列什斯基修道院院长、修道院大司祭皮缅领导。他亲赴工地，几乎每周主持会议，全力推动工程完成。委员会还须为实行共住制的修道院选定院长，并为正式启用做好准备。
1879年10月4日，皮缅为圣伊丽莎白医院教堂举行祝圣仪式，并任命拉法伊拉·罗温斯卡娅为修道院院长，开始主持院务。10月19日，都主教马卡里为施洗者圣约翰斩首主教座堂的主祭坛祝圣。两天后，喀山圣母和圣尼古拉侧祭坛也相继祝圣。
一张摄于1882年的照片呈现了修道院启用不久后的最终面貌：成对的塔楼耸立在绵延的围墙之上，两塔之间可见大门，门后则是主教座堂巨大的穹顶。围墙前尚未出现后来那般拥挤的城市景象。照片让人得以理解贝科夫斯基的城市设计构思：修道院以完整而凝练的正立面朝向小巷，同时又以鲜明的远景轮廓统领整座山岗。
伊丽莎白·马卡罗娃-祖巴切娃既未见到奠基，也未见到墙体建成。玛丽亚·马祖里娜看到了几近竣工的建筑群，却未能等到祝圣之日。尽管如此，她们的构想仍化为清晰而具体的形态：医院教堂、居住楼宇，以及遵循统一章程的修女团体。1879年10月，教堂祝圣标志着修道生活在这里重新开始。历时二十年的建设，最终以修道院正式启用告终。
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